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2014年豬輪狀病毒病例之基因型別分析
Genotype of Porcine Rotavirus in Taiwan in 2014
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作者: 黃有良、鄧明中、張家宜、黃天祥、蔡向榮
中文摘要: 輪狀病毒為誘發豬隻下痢的重要病原之一,依據其表面蛋白VP4與VP7可區分為多種基因型,且各型間交叉保護成效不佳,而過去台灣也未對豬隻輪狀病毒進行深入調查與研究,因此,本試驗將調查2014年輪狀病毒在台灣豬隻下痢所扮演的角色,並進一步分析其基因型別,本試驗共收集2014年全國86場242個下痢檢體進行豬傳染性胃腸炎、豬流行性下痢與輪狀病毒之檢測,結果發現,以豬流行性下痢的檢出率最高,有47場125個樣品呈現陽性,其次為輪狀病毒,有4場12個檢體呈陽性反應,而豬傳染性胃腸炎則均呈現陰性。進一步比對輪狀病毒的病毒蛋白4(VP4)與7(VP7)序列,其屬於G9P19基因型,且其序列與基因庫內的輪狀病毒的序列(包括台灣人型輪狀病毒)均有10%以上的差異,顯示此輪狀病毒與各國動物及人型輪狀病毒均不同,推測此病毒株為台灣本土病毒株。
英文摘要: Rotaviruses are important causative agents for swine diarrhea and are classified into 35 genotypes by the VP4 locus and 27 genotypes by the VP7 locus sequences. Vaccines use to protect swine induce little, if any cross protection between the many VP4 and VP7 genotypes, so genotype identity is crucial in responses to outbreaks . The aim of this study is to survey porcine Rotavirus in swine diarrhea outbreaks during 2014. A total of 86 farms with 242 fecal samples tested as positive for transmissible gastroenteritis virus, porcine epidemic diarrhea virus, and porcine Rotavirus by RT-PCR. The results showed that the predominant pathogen of swine diarrhea was porcine epidemic diarrhea virus. Porcine rotavirus was found only in 4 farms with 12 diarrhea samples and was classified as a G9P19 genotype by phylogenetic analysis of VP4 and VP7. The sequences of VP4 and VP7 in the Rotavirus isolated in this study were less than 90 % homologous than those found in strains from NCBI gene bank, including animal and human sources. These results suggested that the porcine Rotavirus strains discussed here are novel ones originating from Taiwan.
備註: 年份:西元 2016 年
期別:第 50 期
詳細內容:
輪狀病毒為誘發豬隻下痢的重要病原之一,依據其表面蛋白VP4與VP7可區分為多種基因型,且各型間交叉保護成效不佳,而過去台灣也未對豬隻輪狀病毒進行深入調查與研究,因此,本試驗將調查2014年輪狀病毒在台灣豬隻下痢所扮演的角色,並進一步分析其基因型別,本試驗共收集2014年全國86場242個下痢檢體進行豬傳染性胃腸炎、豬流行性下痢與輪狀病毒之檢測,結果發現,以豬流行性下痢的檢出率最高,有47場125個樣品呈現陽性,其次為輪狀病毒,有4場12個檢體呈陽性反應,而豬傳染性胃腸炎則均呈現陰性。進一步比對輪狀病毒的病毒蛋白4(VP4)與7(VP7)序列,其屬於G9P19基因型,且其序列與基因庫內的輪狀病毒的序列(包括台灣人型輪狀病毒)均有10%以上的差異,顯示此輪狀病毒與各國動物及人型輪狀病毒均不同,推測此病毒株為台灣本土病毒株。
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2014年豬輪狀病毒病例之基因型別分析 02黃有良-豬輪狀病毒分子流行病學分析revised-3
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