全球口蹄疫研究聯盟（Global Foot-and-Mouth Disease Research Alliance；GFRA）於2003年由五大國際研究機構發起成立，旨在整合全球研究資源，透過匯集全球口蹄疫領域之專家與研究機構資源，推動口蹄疫診斷技術、防治策略與工具、抗病毒物質之開發與應用，並促進知識與技術交流，以支持全球口蹄疫之預防、控制與清除。該聯盟目前共有31個夥伴、14個合作者及16個利益關係者。隨著全球口蹄疫疫情動態日益複雜，各國研究機構間的即時資訊交流已成為防堵疫情擴散的關鍵。農業部獸醫研究所於2019年8月加入GFRA成為合作者，並於2023年3月簽署合作備忘錄正式成為該聯盟夥伴成員。我國已獲世界動物衛生組織認定臺灣、澎湖、馬祖為不施打疫苗之口蹄疫非疫區，透過參與GFRA相關活動，有助於掌握國際疫情與技術趨勢、維持我國清淨狀態並與國際研究接軌，進而為全球口蹄疫研究與疫情控制貢獻專業能量。