草食動物呼吸道疾病的病原中，細菌雖常為伺機性感染，但其引發的嚴重症狀所導致的經濟損失不容忽視。在台灣草食動物呼吸道細菌性疾病的研究與調查不多，細菌的影響可能被低估。本研究年12月至2017年12月期間共收集61例(8隻牛和53隻羊)呼吸道病例進行菌種的抗原性、毒力因子、菌株親緣性及藥物感受試驗檢測，結果所分離到之98株細菌中，最常見前四名依序為Pasteurella multocida 37株，Mannheimia haemolytica 18株，Moraxella sp. 10株及Bibersteinia trehalosi 5株；其中Pasteurella multocida之主要莢膜型為D型，其次為莢膜型A型。而MLST結果有1株屬於ST79，以及另外5種新的ST型。而Mannheimia haemolytica之MLST結果共有9型，包含ST1、ST2、ST16、ST21、ST28型以及4種新ST型。本次分離之Pasteurella multocida、Pasteurella trehalosi、Moraxella sp.及Mannheimia haemolytica對於amoxicillin/clavulanic acid、ceftiofur、florfenicol及enrofloxacin等藥物大多數具感受性，尚未有抗藥性菌株產生。

關鍵詞：多殺性巴斯德桿菌、溶血性曼哈米亞桿菌、多基因位點序列分型、抗藥性