本所從金門縣新瑤記養牛場送檢之咽喉液中分離到口蹄疫病毒，並經ELISA抗原檢測及病毒核酸序列分析證實為Ｏ型口蹄疫。動物試驗結果顯示此分離自牛隻之O-金門株病毒對豬隻具感染性。根據英國Pirbright 實驗室之檢測結果，O-金門株與O-Manisa、O-Campos、O-Taiwan'98三種疫苗株之 r1 值分別為1.0、0.7、0.4，三種疫苗株均在推薦使用之範圍內。為瞭解目前所使用之豬隻口蹄疫疫苗對O-金門株之攻毒是否有保護作用，以O-台灣，O-Manisa，或O-Campos之疫苗單劑免疫8-9週齡豬隻，於免疫後四週以O-金門株口蹄疫病毒攻擊之。免疫組豬隻均可耐過，三種疫苗免疫後三週之中和抗體幾何平均值分別為84.6，20.6和26.0倍。而未免疫之對照組中和抗體均在3倍以下，於攻毒後2-3天即發生跛足，並於蹄冠部出現水泡。試驗結果顯示此三種疫苗株對O-金門株之攻擊具有保護效果。