豬第二型環狀病毒(porcine circovirus type 2, PCV2) 為一重要豬隻病毒性疾病，感染豬隻所引起之各種臨床症狀統稱為豬環狀病毒相關疾病(porcine circovirus associated disease, PCVAD)。PCV2與其他病原混合感染豬隻之情況十分普遍，且往往可引發較為嚴重之臨床症狀。豬纖鏈病毒 (Torque teno sus virus, TTSuV)亦為近年來一新興豬病，TTSuV之基因型主要為第一型(Torque teno sus virus type 1, TTSuV1)以及第二型(Torque teno sus virus type 2, TTSuV2)，在世界各國養豬場亦有極高之流行率。為了解PCV2和TTSuV在台灣混合感染情形，因此收集2011至2014年間243個豬隻檢體，應用環式恆溫增幅法(loop mediated isothermal amplification, LAMP)以快速診斷PCV2病毒，以及應用巢式聚合酶鏈反應法(nested polymerase chain reaction, nested PCR)診斷TTSuV1以及TTSuV2病毒。結果顯示PCV2病毒之陽性率為93.4％；TTSuV1、TTSuV2單獨感染以及二病毒混合感染(TTSuV1/TTSuV2)之陽性率分別為6.1％、8.2％及83.5％。PCV2分別與TTSuV1、TTSuV2混合感染以及和TTSuV1/TTSuV2混合感染之陽性率分別為6.1％、8.2％與78.6％。