禽類肉毒中毒又稱軟頸症，乃一因食入肉毒桿菌（Clostridium botulinum）分泌之毒素造成癱瘓甚至死亡之疾病。肉毒桿菌可產生A ~ G等7種不同型別的神經毒素，於禽類較常發生的為C型肉毒中毒，而禽鳥D型與E型肉毒中毒病例亦曾有報告。肉毒中毒可發生於各種年齡之家禽與野鳥，初期出現腳部麻痺，接著由腳部推展至雙翼、頸部與眼瞼部，最後造成心臟與呼吸衰竭死亡，因本病死亡之鳥類屍檢時，大多無明顯之肉眼與顯微病變。確診肉毒中毒需由病禽血清中或胃腸道之洗滌液中證實是否存在有肉毒桿菌的毒素，可利用蹊鼠進行腹腔注射加以證明，若檢體中有肉毒毒素存在，蹊鼠將出現呼吸困難、腹式呼吸等肉毒中毒徵狀，且通常於72小時內死亡，之後再以蹊鼠進行毒素中和試驗進行毒素型別之鑑定。證實肉毒桿菌是否存在於檢體中在診斷上較不具意義，但仍可嘗試分離肉毒桿菌或進行PCR偵測毒素基因作為輔助診斷。本實驗室已建立禽類肉毒中毒病例之診斷流程，並分別診斷出2002年黑面琵鷺與2004年小水鴨之C型肉毒中毒病例。