新城病在台灣已有長遠歷史，自1934年有病例報告迄今，一直存在本島肆虐，為對台灣禽類影響相當嚴重之甲類惡性傳染病，其近代在台灣造成之大流行共有三次，分別為1969、1984及1995年，其所造成之損失相當嚴重，同時也對防疫工作造成相當大的困難。隨著生物生物技術的演進，可以解讀出病毒基因，應用病毒核酸之排列差異來觀察新城病病毒株間之演化親緣關係，作為流行病學上的分析，由於關係新城病病毒毒力是融合蛋白之切割位氨基酸序列，所以融合蛋白之基因通常被利用來探討此病毒之流行病學，本工作內容即是延續先前楊程堯等人針對於1995年大流行所分離之病毒株進行之分析，來監測此一病毒在台灣之演化及流行趨勢，結果顯示近年來由雞隻所分離之病毒株所進行之演化及流行分析顯示病毒株相當集中皆歸類於第七基因型中，但在鴿子及鵝、鴨分離之病毒株雖有部份同樣歸屬第七基因型，但並不與雞隻所分離之病毒株集中，顯示以往所流行於台灣之新城病病毒株可能藉由雞隻以外之禽類保毒，值得防疫機關注意並慎防此類病毒再次爆發流行。