近年來，在牛、羊的流產病例及鴿子發育不良的病例，皆能分離出致病的披衣菌，顯示該菌已造成飼養者的損失，故對該病原的防治措施須加強，以期減少疾病的傳播。由於披衣菌 (Chlamydia)感染家畜禽的對象極廣泛，如牛、羊、豬、雞、鴉、犬、貓、鴿子及家中飼養的鳥類等多種動物都會受感染而發病。因此披衣菌的傳播非常普遍，同時動物的披衣菌也會經由接觸而感染人，故稱披衣菌症是為人畜共通傳染病。

一般的動物，受披衣菌感染後都沒有特殊的臨床症狀，如牛、羊、豬在感染後造成流產，經診斷才知道是披衣菌感染。而披衣菌感染家禽後，有時雖然會引起呼吸異常，但因沒有典型症狀或是造成大量損失而容易被忽略。但如果這披衣菌和其它疾病合併感染，且造成嚴重疫情時，才在診斷後發現有披衣菌感染。因此，動物的披衣菌感染，往往是呈不顯性感染。所以對披衣菌感染的防治，應加強對披衣菌帶原動物的檢驗，如檢驗出是披衣菌帶原動物，可以用四環素類抗生素進行隔離治療，或是陶汰帶原動物。並且在畜舍週圍加強圍籬設施，減少外來動物侵入。若牧場發現有流產疫情，可和家畜疾病防治所聯絡，及保留流產胎供化驗診斷。發生流產的動物須先隔離，然後對畜舍消毒，避免病原擴散。

由於披衣菌是以不顯性感染方式傳播，所以一般農民及飼養鴿子的畜主或是飼養寵物的民眾，可能因為接觸披衣菌的帶原動物而受感染，但因為沒有症狀而不自覺。筆者在87 年間，收集獸醫從業人員，以及飼養牛、羊的畜主血清，進行披衣菌抗體檢測，結果有將近70%受檢人員的血清抗體呈陽性反應，這顯示大部份常和動物接觸的人已受披衣菌感染。但由受檢人員的健康情形自述，並未顯現出特別的病狀。所以對大部份的人而言，雖然是被感染，但對於健康是沒有影響；儘管有些人可能會常有眼結膜炎，或是時常感覺上呼吸道不舒服，但因為這些症狀也可能是有其它原因造成，故須進一步檢查和追蹤供診斷。但由受檢人員披衣菌抗體檢查呈陽性反應，顯示我們暴露在容易被感染的環境中，我們一定要加強自己的衛生習慣，和保持工作環境與器械的乾淨。

進行畜主們或是動物的披衣菌抗體檢查，是為了解疾病傳播的情形，以加強我們的衛生措施。這是給我們一種預警，以保護我們自身的安全。披衣菌的預防，只有靠早期檢驗、注意畜舍消毒，和隔離治療受感染動物，以減少披衣菌傳播感染的機會。披衣菌是透過接觸感染的人畜共通傳染病病原，所以在日常飼養管理工作時要注意衛生管理，減少病原傳播，如此就不用擔心披衣菌感染症。