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隨著時代變遷，鴨、鵝等水禽類養殖形態已由傳統庭院式飼養，轉為集約圈飼，雖然因此產值會大幅提昇，然而疾病亦隨之增多。李等【李等，1998】蒐集1996 至1997 年本省鴨、鵝之病例，發現鴨隻病例中細菌性疾病占85﹪，其中以傳染性漿膜炎及家禽霍亂最為常見，病毒性疾病包括鴨病毒性肝炎、鴨小病毒感染症等。鵝的病例中細菌性疾病亦達85﹪，病毒性疾病以鵝病毒性腸炎最為重要。龔等【龔等，2000 年】蒐集1995 至1999 年發生之家禽霍亂病例，發現在鴨、雞之間有交叉感染及流行，且多數地區分離到的菌株已遍佈全省。許及黃【許，2000 年，黃，2002 年】分別以ELISA 法及間接螢光法檢測鴨、鵝小病毒之抗體，發現南部地區之抗體陽性率高於北部及中部。2002年至2003年本所接受全省各縣市防治（疫）所送檢鴨隻病例中以傳染性漿膜炎最多，其次為鴨小病毒感染症與鴨病毒性肝炎；鵝病例中以鵝小病毒感染症居多，其次為家禽霍亂與大腸桿菌感染症。顯然近年來本省鴨、鵝飼養場中仍存在傳染性漿膜炎、家禽霍亂、鵝小病毒感染症與鴨小病毒感染症等疾病，持續困擾飼養農戶造成農戶經濟損失。緣此，本計畫擬應用流行病學、病理學、微生物學及電子顯微鏡學技術，調查及診斷台灣目前水禽疾病之發生情形，進而研擬防疫措施。