輪狀病毒為誘發豬隻下痢的重要病原之一，依據其表面蛋白VP4與VP7可區分為多種基因型，且各型間交叉保護成效不佳，而過去台灣也未對豬隻輪狀病毒進行深入調查與研究，因此，本試驗將調查2014年輪狀病毒在台灣豬隻下痢所扮演的角色，並進一步分析其基因型別，本試驗共收集2014年全國86場242個下痢檢體進行豬傳染性胃腸炎、豬流行性下痢與輪狀病毒之檢測，結果發現，以豬流行性下痢的檢出率最高，有47場125個樣品呈現陽性，其次為輪狀病毒，有4場12個檢體呈陽性反應，而豬傳染性胃腸炎則均呈現陰性。進一步比對輪狀病毒的病毒蛋白4(VP4)與7(VP7)序列，其屬於G9P19基因型，且其序列與基因庫內的輪狀病毒的序列（包括台灣人型輪狀病毒）均有10%以上的差異，顯示此輪狀病毒與各國動物及人型輪狀病毒均不同，推測此病毒株為台灣本土病毒株。