為避免新興疾病對我國白蝦養殖產業造成危害，本所收集9場田間白蝦場其生產過程之蝦隻檢體及環境檢體(如生餌、水及土壤等)，監測世界動物衛生組織表列疾病及2種新興蝦類病原，包含白點病、傳染性皮下及造血組織壞死症、陶拉症病毒、黃頭病毒基因1型、傳染性肌肉壞死症病毒、壞死性肝胰腺炎、急性肝胰臟壞死症、對蝦肝胰腺微孢子蟲病、偷死病病毒，確認是否有病原存在，並據以輔導白蝦場改善其生物安全環境與防治疾病。共完成白蝦檢體724件次及環境檢體948件次檢測工作，其中檢出率最高為對蝦肝胰腺微孢子蟲病12.9% (215/1672)，其次為急性肝胰臟壞死症1.8% (30/1672)。統整各場於輔導過程中所遇到的問題，建議白蝦場需引入未帶病原之蝦隻進行養殖，養殖前場內環境需徹底清潔消毒，且養殖過程會加入池水的物質(包含餌料生物、水源、益生菌等)，需確認其未帶病原及弧菌。最後需確保養殖池不會被人員或動物汙染病原。