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免疫過或是感染恢復的個別動物，能夠免於口蹄疫病毒的感染，最主要是受到口蹄疫中和抗體的保護。不活化的口蹄疫疫苗也像其它疫苗一樣，具有保護宿主免於感染或是使疾病減輕的作用，但是並無法提供阻絕性的免疫，例如一些免疫動物經過活病毒的攻擊後，病毒也能在上皮表面增殖，這也包括形成所謂的帶毒狀態。所幸，豬隻並不會形成帶毒狀態。而高抗原含量的口蹄疫疫苗，只要單次免疫牛隻，就能保護其免於高量口蹄疫病毒攻擊時的感染，重覆免疫的補強免疫反應，顯著地增加中和抗體反應的量與持續時間，將可預期能更有效的阻絕病毒的局部增殖以及感染點的病毒擴散。當然有效的免疫也必須考慮到整個牧場的群體免疫力，保護全場動物，就可大大的降低病毒入侵免疫力較差動物的機會。這對豬來說，更是重要，因為豬一旦感染口蹄疫，可以釋放出大量的口蹄疫病毒，就可能壓過宿主的免疫大軍，而發生感染現象。一般而言，一個牧場要達百分之八十以上的有效免疫個體，才能提供較好的群體免疫力。