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口蹄疫（FMD）為偶蹄動物之高度傳染性疾病，主要感染之經濟動物為牛、羊及豬。國內家畜全面施打口蹄疫不活化疫苗，由於不活化疫苗不會產生非結構蛋白抗體，而動物自然感染才會產生，故常以市售的ELISA套組來檢測血清中非結構蛋白（NSP）抗體作為區別口蹄疫自然感染與疫苗免疫的依據。因此，口蹄疫非結構蛋白抗體的檢測常被列為例行性檢測，俾利田間口蹄疫之監控。目前國內使用檢測NSP的方法有美國UBI （3B）、荷蘭Ceditest （3ABC）、瑞士Chekit（3ABC）等三種ELISA套組。為了方便讓第一線工作人員現場使用並快速獲得測試結果，因而開發pen-side快速診斷試劑套組。本試劑套組是利用固相色層分析原理設計，其優點為操作簡便，不需仰賴儀器，只要一滴血清即可在50分鐘內快速完成檢測。本系統針對口蹄疫病毒之非結構蛋白核酸序列設計引子，以RT-PCR方法增幅病毒核酸，經由原核系統進行基因重組、轉形作用及表現載體等方式構築而成。試驗結果顯示，Pen-side測試棒之敏感性可達93.3 ~ 95.6 % 及特異性可達98.8 ~ 100 %，另經試驗証實可同時檢測口蹄疫O、A、C、Asia 1等四種血清型別，且不會與其他病原產生非特異性反應。