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豬瘟乃引起高傳染性及致病性之豬隻重大疾病，主要以高熱及出血為特徵。豬瘟之病原為豬瘟病毒（Classical swine fever virus, CSFV），目前分類於黃病毒科（Flaviviridae）中之瘟疫病毒屬（Pestivirus）。豬瘟病毒為二十面體，具有封套之病毒，封套上帶有三個醣蛋白（glycoprotein）分別為E0、E1及E2，其中E0及E2為主要產生中和抗體之醣蛋白。豬瘟病毒其基因體約為12.3 kb，依其轉譯之產物可分為C、E0、E1及E2四個結構蛋白及Npro、NS2-3、NS4A、NS4B、NS5A及NS5B等七個非結構蛋白。NS5B主要功能為一核醣核酸依賴型核醣核酸聚合酵素（RNA-dependent RNA polymerase, RdRp），於複製病毒基因上扮演極重要之角色。由於豬瘟病毒不論強毒型亦或是弱毒型，其血清型只有一種，故於毒株分類及流行病學追蹤上常造成困擾，目前許多國外的學者應用定序其NS5B基因片段方式進行分類及追蹤，其結果亦普遍應用於流行病學之研究。