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2002年7月首次自苗栗一豬場分離出一未知病毒，利用Random primers以RT-PCR方法增幅該病毒部份核酸，並經基因選殖之後定序，將病毒之非結構性蛋白(nsP1)及醣蛋白(E1)之核酸序列經NCBI GenBank比對分析，證實為鷺山病毒(Sagiyama virus, SAGV)。和其他文獻所分離到之病毒序列相比，其核酸相似性均在96﹪以上，其中E1序列更與台灣衛生署疾病管制局(CDC)從蚊子分離出之鷺山病毒序列相似性高達99.6﹪。鷺山病毒屬Togaviridae科，Alphavirus屬，為arthropod-borne的病毒，1956年首次在日本由蚊子分離出，並經實驗證實鷺山病毒對馬隻有病原性，實驗馬隻會有發燒、起疹子、後肢水腫及顎下淋巴結腫大的臨床症狀。在人、豬隻及鳥類則會誘發自然性中和抗體的產生。在臺灣豬隻的中和抗體調查方面，從11個縣市收集上市肉豬血清共586隻，經力價測試後，顯示抗體陽性率(≧4X)高達51﹪，但在離島的陽性率則偏低，澎湖縣甚至全為陰性。現正進行豬隻接種試驗，以觀察鷺山病毒在豬隻是否有病原性，及病毒在豬隻體內的分布情形。