魚類虹彩病毒基因選殖
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虹彩病毒可感染脊椎及非脊椎動物,包括昆蟲類、魚類及兩棲類等,虹彩病毒科目前區分為五個屬(genus),病毒顆粒係二十面體(icosahedral),直徑為120 - 300 nm,MCP (major capsid protein)蛋白佔有整個病毒顆粒polypeptide的百分之40至45,病毒複製發生在細胞核內及細胞質內兩階段,在細胞質內可形成concatamers,病毒的DNA在CpG殘基cytosine的位置有很高程度的甲基化,在脊椎動物病毒顆粒經由budding獲得外封套。本次使用的魚類虹彩病毒係由石斑魚(grouper)分離得到,經由GK細胞株繼代8代後進行試驗,病毒的DNA經萃取後,以限制脢HindIII切割後,進行基因選殖及序列分析,其中兩個質體含有MCP基因片段,依得知的基因DNA序列,重新設計引子(primers)進行PCR反應,構成完整的MCP基因序列,其大小約1392核甘酸,轉譯成463個氨基酸,經上網進行核甘酸序列分析比對,本病毒株與Ranavirus屬的相似度較高,約為百分之70;與魚類淋巴囊腫病毒(Lymphocystivirus)相似度較低,約為百分之24。另以軟體進行氨基酸序列分析,預測的抗原決定位之位置主要位於親水性的氨基酸區域。