沙門氏桿菌症是畜產養殖業的一大困擾，感染沙門氏桿菌所引起的主要的臨床症狀包括患畜下痢、失重、生長率下降及死亡等，經常造成畜產養殖的重大經濟損失，感染沙門氏桿菌也可能引發呼吸道疾病甚或敗血症等。沙門氏桿菌感染同時是公共衛生上一個重要的議題，病原菌常藉由食物污染而感染人[14]估計在美國一年因人沙門氏桿菌感染損失接近十億美元[3]。目前政府積極推動之「危害分析重要管制點」(HACCP) 系統，強調預先防範危害的發生，以達成食品衛生安全的嚴格標準。在此衛生監督管理制度中，沙門氏桿菌的污染也是一項重點檢驗項目。因此在獸醫、醫學、公共衛生及環境保護等領域，沙門氏桿菌的污染檢測均是一項重要的工作。也因此目前市售沙門氏桿菌的鑑定套組為數眾多，例如利用生化特徵鑑定的至少有18 種、核酸分析鑑定的至少有4種、血清學鑑定則至少有25 種以上。

　　沙門氏桿菌屬之血清型超過2400 種，還陸續增加中。依照國內衛生署、美國FDA 或OIE 公告的傳統鑑定方法包括培養、生化試驗及血清學鑑定至少需時4-7 天。一個檢體最少需作10 種以上的生化性狀及血清學測試，所以檢體數量太多時處理相當困難。此外檢體保存不當、雜菌太多或抗生素的使用等都會影響細菌分離率，而菌落如轉變成粗糙型則會影響血清型鑑定。因此為了縮短鑑定時間，本研究研發利用聚合酶連鎖反應(polymerase chain reaction，PCR)來輔助沙門氏桿菌之鑑定。