豬生殖與呼吸道綜合症(porcine reproductive and respiratory syndrome, PRRS)是一種以母豬繁殖障礙和各年齡層豬隻的呼吸道感染為主的豬隻傳染病，易併發二次性感染而死亡。愈年幼的豬，併發症愈嚴重，導致死亡率增加，造成經濟上很大的損失。豬生殖與呼吸道症候群病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV）是一種具封套、單股正極性的 RNA 病毒。核酸長度約為 15 Kb，共有 8 個開放讀碼區 (open reading frames, ORFs)。其中ORF5基因轉譯出封套蛋白，與誘發宿主中和抗體的產生有關。經基因序列比對可將全世界PRRSV分為歐洲株和北美洲株兩大群。本次實驗將自2002年至今由國內各地分離之40株病毒株利用反轉錄聚合?鏈反應（reverse transcription-polymerase chain reaction）增幅其ORF 5 片段，將所得產物再以 MluⅠ、HincⅡ、SacⅡ及HaeⅢ等四種限制酶切割，並比較所得的限制酶切割位置組合型(restriction fragment length polymorphism RFLP)，同時以樹狀圖分析(phylogenetic analysis )方式充分探討臺灣不同病毒株之間ORF5的基因變異。由本實驗結果顯示台灣各豬場的PRRSV變異很大，而且不容易去推論PRRSV在國內地理位置上的分布特徵，但並未發現歐洲型病毒株。